Впервые Государственная автоматизированная система "Выборы" работала в таком режиме.

12 марта 2006 года в Российской Федерации впервые состоялись выборы в регламенте единого дня голосования. В выборах участвовали 68 избирательных комиссий субъектов Российской Федерации, 386 территориальных избирательных комиссий, 21503 избирательных участков. В трех регионах применялись комплексы обработки избирательных бюллетеней, установленные на избирательных участках для автоматизации учёта голосов избирателей. В Центральной избирательной комиссии России была принята и обработана информация по 522-м избирательным компаниям.

ГАС "Выборы" обеспечила полную обработку предварительных результатов голосования к шести часам утра 13 марта 2006 года, при этом было принято и обработано 28571 протоколов голосования избирательных комиссий различного уровня.